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    蘇鐵綺灰蝶的來源檢測與綺灰蝶屬食性演化之研究
    (2010) 吳立偉; Li-Wei Wu
    因食物或園藝造景之用而引入的外來植物，雖然不一定會直接危害原生物種的生存，但可能間接地影響到利用這些植物的昆蟲，進而改變其演化過程。以蘇鐵綺灰蝶(Chilades pandava)為例：自1990年以來，台灣地區引入大量的蘇鐵屬(Cycas)植物作為庭園造景之用，直接或間接地造成蘇鐵綺灰蝶的族群快速擴張，現今已分佈全台。本論文的第一部分以蘇鐵綺灰蝶的事件來討論外來園藝植物對原生昆蟲族群之遺傳結構的影響，並追溯大發生族群的來源。 綺灰蝶屬的成員為體型最小的蝴蝶之一，分佈範圍可從非洲西部橫跨到亞洲東部，並且除了一般專食豆科及芸香科植物的蝶種外，亦包含有較罕見的專食蘇鐵科植物的成員。由於綺灰蝶屬的分佈範圍和食草的利用關係並不常見於其它屬的蝴蝶中，因此懷疑綺灰蝶屬是否為單系群(monophyly)。本論文將在第二部分討論綺灰蝶屬成員的親緣關係，以暸解此屬的食草利用格局。 第一部份將世界各地共810隻蘇鐵綺灰蝶樣本，進行粒線體COII序列分析，得有29個基因型，其中台灣各地大發生的族群所擁有的主要基因型C僅分佈在台灣。此結果支持台灣各地大發生的族群來自島內族群擴張，並非人為引進蘇鐵時所夾帶的外來族群；在第二部分，為了建構綺灰蝶屬內的成員以及食性利用之間的關係，共採用13種綺灰蝶屬的成員以及42種近緣的蝴蝶作為分析(3437bp, 82 taxa)，發現目前歸類為綺灰蝶屬的蝴蝶並非單系群。但若將處理為同物異名的晶灰蝶屬(Freyeria)獨立出來，則綺灰蝶屬為單系群。儘管綺灰蝶屬仍包括利用裸子及被子植物的種類，但是利用蘇鐵為食的成員自成一群，顯示以蘇鐵為食的行為為單一的寄主轉移事件。 此論文的結果架構出台灣地區蘇鐵綺灰蝶之擴散來源，同時指出外來園藝植物之引進使得蘇鐵綺灰蝶的角色轉變為園藝害蟲，並可能加害原生種台東蘇鐵的生存，建議長期監控園藝蘇鐵的貿易方能保護原生蘇鐵之生存。而根據分子親緣關係樹，我們將晶灰蝶屬自綺灰蝶屬中獨立出來，不僅指出綺灰蝶屬可能為非洲起源的類群，並且提供灰蝶親緣關係最複雜的類群之一―藍灰蝶組(Eliot’s Polyommatus section)重建其屬級分類的可能性。
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    台灣產冷水麻屬植物之分類研究
    (2011) 楊承瑞; Chen-Jui, Yang
    本研究利用外部形態、地理分布、葉綠體trnL-F基因序列和核ITS基因序列等資料，對台灣產冷水麻屬植物進行分類研究。外部形態研究結果顯示托葉形態、葉緣形態、葉片氣孔與鐘乳體的分布、花被數目和形態為重要分類特徵，植株習性、毛被的有無、花序和瘦果微細形態亦可提供分類的參考；本研究結果將台灣產冷水麻屬植物處理為14個分類群，將Pilea peploides var. major併入P. peploides，且將P. sinofasciata併入P. matsudae，另將P. miyakei處理為疑問種，其餘皆支持第二版台灣植物誌的處理。 Weddell及陳家瑞曾以形態特徵為主要依據分別提出兩個不同的屬內分類系統，但Monro根據分子研究已證實這兩個以形態建構的屬下分類系統並無法反映本屬植物之親緣關係。本研究利用葉綠體trnL-F基因序列和核ITS基因序列建構親緣關係樹，檢視本屬各分類群之間的關係，並訂正陳家瑞建構的屬下分類系統。結果顯示P. japonica與長梗盤花麻歸在同一支序，分類地位必須重新檢討；過去所定義的四萼組為一旁系群(paraphyly)，三萼組和冷水花組則為多系群(polyphyly)。本研究重新修訂四萼組的形態特徵及範圍，也提供其餘支序與形態特徵和地理區系的關聯，以利未來進一步的屬下分類訂正。
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    颯弄蝶屬之分子親緣與系統研究
    (2013) 莊懷淳; Huai-chun Chuang
    親緣關係為生物研究的基礎，弄蝶親緣關係已有高階親緣關係發表，在屬級的親緣關係尚有不足之處。颯弄蝶屬屬特徵為前翅2A至R3脈之間有透明的斑紋與後翅具有大片的白塊。因颯弄蝶種之間的形態太過於相似，許多發表尚有辨識錯誤的情形。Evans在1949整理為7種，Okano (1987) 和Chiba (1989) 則認為颯弄蝶屬為 valentini, zulla, gopala, nymphalis, splendens, monbeigi和 formosibia。以翅形與幼蟲型態S. formosibia與S. monbeigi應屬於同一類群，但是前者外生殖器卻並不典型。Shirôzu將S. majasra處理為gopala的亞種，但Tsukiyama處理為nymphalis的亞種。颯弄蝶屬近緣屬皆為熱帶分布，颯弄蝶卻分布自爪哇至溫帶的西伯利亞。建構颯弄蝶屬親緣關係可以確立formosibia及majasra的分類地位並且了解颯弄蝶屬的溫帶分布是由熱帶分布至溫帶或原本分布在溫帶。本研究使用COI, COII與Ef1α基因，以最大簡約法、最大概似法與貝式推斷進行親緣關係分析。結果顯示颯弄蝶屬為一個單系群，並且各個種為單系群，可以反映現在的分類是沒有問題。並且更能確定formosibia與monbeigi為同一群。從樹型可知majasra不屬於gopala或是nymphalis的亞種，建議提升為一個種，且颯弄蝶屬是由熱帶分布至溫帶並且適應溫帶的環境。
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    綠弄蝶屬之分子親緣與生物地理研究
    (2015) 金宣安; Chin, Hsuan-An
    中國西南部至華萊士區具複雜地質歷史與高度的生物多樣性，吸引著生物地理學家與演化生物學家，但過去對本區與其餘印度太平洋海域間的生物地理關係以及物種在本區內分布的鱗翅目研究數量稀少。綠弄蝶屬的分布範圍跨越了此地區並演化出許多特有亞種，可能為了解此區地質歷史對生物分布影響的理想研究材料。達成此目標需要可信的綠弄蝶屬屬內親緣關係，但不同學者對綠弄蝶屬中各分類群的分類地位看法不一而且混亂。本研究利用粒線體基因COI、COII與核基因Ef-1α重建綠弄蝶屬的親緣關係，釐清屬內分類，再藉由分子鐘定年與祖先區域重建探討綠弄蝶屬的分布與分化歷程；另藉由分子親緣關係重建翅紋祖徵狀態。親緣關係建構結果支持Chiba利用交尾器所做分群，另顯示C. hemixanthus中可能有隱藏種。分子定年與祖先區域重建結果顯示綠弄蝶屬可能在白堊紀晚期起源於亞洲大陸，於中新世至漸新世向西、向南擴散並隔離分化。而其翅紋相似性發生於不同支系之間，為平行演化的結果。本屬種級以上的分化主要由地理隔離造成，種內則多為由氣候影響之海平面升降導致的隔離分化。而其翅紋平行演化的歷程尚待探討，擬態與氣候因子為可能因素。
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    Biosystematics and Biogeographical Implification for Ypthima multistriata Species Group in Taiwan
    (2004) 謝佳昌; Chia-Chang Hsieh
    Ypthima multistriata species group is proved to be composed of three species in Taiwan, and they are Y. esakii, Y. multistirata, and Y. akragas. Y. wangi is also considered as the same species in this study. Morphological difference was found between different populations of Y. esakii in various habitats, southern Taiwan, northern Taiwan, northeastern Taiwan, and GuiSan island. In Ypthima multistriata species group, multiple-variable regression shows, except for Y. multistriata in the southern and central Taiwan, the size of the first ocellus responds positively to the increase of temperature. In the second ocellus, the size of it doesn’t show a significant relationship with temperature. However, the difference between these two eyespots increases as temperature goes up. To ensure the difference between the eyespots can be a useable trait in classification of this species group, an F test on the difference between eyespots among every taxon was carried out and showed that the this trait can help in identifying Y. esakii in the southern/central Taiwan. To reassure the taxonomic status of these taxa, COI, COII, and ND5 genes of mitochondria DNA are utilized to examine if any divergence occurs among those undetermined taxa, namely, the Y. esakii populations in southern Taiwan versus those in northern Taiwan, and the population in the northeastern Taiwan versus Y. wangi on GuiSan Islet. Y. formosana, Y. angustipennis, Y. tappana, and Y. norma as the outgroups are designated as the outgroup. 583 bp of COI gene are acquired, and across all taxa 56 sites/ 583 bp (9.6%) are parsimoniously informative. From a heuristic search of unweighted nucleotide data set, one most parsimonious tree was obtained, 65 steps long. As the data set generated high CI value (0.9062), homoplasy is evidently low. All the bootstrap values and Bayesian supportive values are all above 60, mostly above 75, which show that the linking of each node is robust enough. Based on the phylogenetic tree, these taxa were grouped into four main clades. The first clade is composed of different populations of Y. esakii, Y. wangi, and the morphologically similar population in the northeasternTaiwan. The clade consisting of these taxa presents 0% divergence on the 583 bp of the surveyed COI sequence. In sequences of ND5 (500 bp) and COII (409bp), no a single base pair of variation has been found. The other three clades are composed of Y. multistriata, two subspecies of Y. multistirata and Y. akragas. To endorse the result from phylogenetic result, interbreeding is carried out. No reproductive boundary has been found among Y. esakii in southern Taiwan, Y. esakii in northern Taiwan, and NanYa form. It can be concluded they are the same species with different external morphological traits.