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    臺灣產貓蛛科蜘蛛之系統分類和都市化對其遺傳多樣性之影響
    (2024) 羅英元; Lo, Ying-Yuan
    在面臨生物多樣性持續流失的壓力下，加速釐清野生物的多樣性資訊、親緣關係和生態演化是生物多樣性保育的重要基礎。貓蛛科蜘蛛為狼蛛總科的成員，是物種多樣性相當高的遊獵型蜘蛛，廣泛分布於草生地、灌木叢和樹冠層等不同棲息地，也是都市、農業生態系中相當普遍的蜘蛛之一。牠們在臺灣的物種多樣性是被大幅低估的，因此本研究首先對臺灣產貓蛛科進行全面性的分類整理，並使用整合性物種界定方法探討牠們的物種界限，包含ABGD、ABSP、bPTP、 GMYC、BPP等。根據形態證據，共整理出5屬16種，包含7個新種（Hamataliwa cordivulva sp. nov.、Hamat. leporauris sp. nov.、Oxyopes hasta sp. nov.、O. taiwanensis sp. nov.、Tapponia auriola sp. nov.、T. parva sp. nov.、T. rarobulbus sp. nov.）和7個新紀錄種（Hamadruas hieroglyphica (Thorell, 1887)、Hamat. foveata Tang& Li, 2012、O. fujianicus Song & Zhu, 1993、O. sertatoides Xie & Kim, 1996、O. striagatus Song, 1991、O. sushilae Tikader, 1965、Peucetia latikae Tikader, 1970），而 P. formosensis Kishida, 1930 則列爲疑問種。依據K2P模型計算樣本間的COI基因遺傳距離，結果顯示以遺傳距離3%為閾值可有效鑑定多數物種，然而部分物種間的界限並不明確，例如 O. sertatus 和 O. taiwanensis sp. nov.，以及 Hamat. cordivulva sp. nov. 和 Hamata. foveata 之間都有明確的生殖結構差異，但是ABGD、ASAP、bPTP、GMYC等方法都無法區別；相反的，T. parva sp. nov. 的種內遺傳距離大於4%，但未有明確的形態分化證據。此外，本研究透過5個分子遺傳標記（12S rRNA、18S rRNA、28S rRNA、COI、histone H3）來釐清貓蛛科內的親緣關係，資料集共包含6屬42種。最大似然法（ML）和貝葉斯推理法（BI）所重建的分子系統發育樹支持貓蛛科包含3大支系，包括：（1）Peucetia和 Tapinillus；（2）Oxyopes；（3）Hamadruas、Hamataliwa和Tapponia。除了 Tapponia 以外，各屬皆為單系群，但Hamataliwa 和 Tapponia 之間的關係和屬徵定義有待釐清。透過幾何形態學方法分析背甲形狀和眼式位置的變異，發現除了Hamadruas和Oxyopes的形態空間完全重疊之外，背甲形狀在不同性別及各屬之間皆具有明顯的差異，並且展現系統發育信號；同時，我們也探討背甲形狀變異與貓蛛的步足形態與活動模式之間的關聯，發現貓蛛科可能起源於較頻繁移動的活動模式，其步足相對較長、背甲也具有更寬大的胸區，其後演化出定棲活動模式的類群，其步足比例較短，背甲胸區則未特別突出。斜紋貓蛛（O. sertatus）是臺灣低海拔山區、農地及都市綠地廣泛分布的物種，因此是探討都市化過程對野生物遺傳多樣性影響的理想材料。目前有兩個假說被提出，即「都市破碎化模型」預期都市對生物的擴散是種屏障，而「都市促進模型」則預期都市對適應者的擴散來說扮演著廊道的作用。我們於台中及南投地區選取17個不同都市化程度的樣點，利用4 km2（地景尺度）及0.25 km2（局部尺度）範圍內土地利用組成作爲量化都市化程度的依據，並利用COI與RAD-seq資料分析斜紋貓蛛族群內的遺傳變異、族群間的遺傳分化和遺傳結構。結果顯示，許多遺傳多樣性指數都有伴隨都市化程度增加而下降的趨勢，特別是雜合度觀測值（observed heterozygosity, HO）在0.25 km2及4 km2尺度下，以及對偶基因豐富度（allelic richness, Ar）在4 km2尺度下皆有顯著的降低，不過核苷酸多樣性則不受影響；此外，族群間的COI及RAD-seq遺傳分化指數，在都市區域顯著高於非都市區域。這些結果皆符合「都市破碎化模型」的預期，即都市內因自然棲地有限、面積小且互相隔離，導致小族群、遺傳漂變作用增強及遺傳多樣性的流失；不過STRUCTURE和PCA分析結果並未顯示有族群遺傳結構，表示都市和非都市族群間仍有相當程度的基因流動。總結來說，本論文作為首次探討全面探討貓蛛科蜘蛛的物種多樣性和親緣關係，強調了形態診斷與其他整合性物種界定方法對精確評估物種多樣性的重要性，以及背甲形態在親緣關係和活動型態適應的關聯；最後，也突顯改善都市自然棲地的品質與連結的需求，以確保都市野生物、生態系統服務與功能的永續發展。
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    乳酸桿菌 GR0877 對葡聚糖硫酸鈉導致腸道炎症小鼠模式的預防作用
    (2024) 王科鑒; Wang, Ke-Chien
    過去認為母乳是無菌的，但後來發現母乳中具有乳酸菌 (lactic acid bacteria, LAB) 的存在，乳酸菌中的乳桿菌屬 (Lactobacillus) 是最常見的菌屬，且目前許多的研究發現乳汁中除了擁有乳桿菌屬外，還有雙歧桿菌屬 (Bifidobacterium)、葡萄球菌屬 (Staphylococcus)、擬桿菌屬 (Bacteroides)、梭菌屬 (Clostridium) 及腸球菌 (Enterococcus) 等等，不過母乳中菌屬會隨著不同族群以及女性個體差異會有所不同。有很多證據顯示，乳酸桿菌具有抗發炎的效果，且也有研究指出乳酸桿菌對於哺乳女性以及健康兒童有正面的影響，使得乳酸桿菌成為益生菌的新目標。本次研究想要探討乳酸桿菌的益生特性，使用葡聚糖硫酸鈉 (dextran sodium sulfate, DSS) 誘導小鼠產生潰瘍性結腸炎，使用乳酸桿菌來評估改善腸道發炎的效果。本次實驗挑選過去實驗室利用細胞模式篩選出來的乳酸桿菌，本研究利用該乳酸桿菌使用於潰瘍性結腸炎的動物模式，將乳酸桿菌分為活菌以及熱殺菌，探討兩種母乳酸桿菌預防與改善腸道發炎的能力。實驗結果顯示，餵食熱殺菌的實驗小鼠，糞便潛血、結腸長度與糞便型態均有顯著改善，而餵食活菌的實驗小鼠，在糞便潛血與糞便型態有顯著改善，進一步組織學分析發現餵食母乳酸桿菌的腸壁完整性、細胞浸潤、潰瘍等等均有改善，腸道組織的緊密連接 (tight junction) 相關分子也有受到改善的情形。藉由以上結果得知，該乳酸桿菌對於緩解腸道發炎症狀具有良好的預防效果，未來可作為在探討益生菌對於腸道發炎的相關研究，並且具有可應用於舒緩臨床潰瘍性結腸炎患者的潛力。
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    ISX-Galectin-9 訊號軸在 BCP-ALL 中對骨髓微環境之影響
    (2024) 邱瓊英; Chiu, Chiung-Ying
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    太田樹蛙受恙螨之感染現象與其宿主性別和環境因子之關聯
    (2024) 傅宇軒; FU, Yu-Syuan
    性別差異感染普遍存在於寄主類群中。雌性與雄性宿主受寄生蟲感染程度不同的現象可能源於其行為或生理上的差異，大多數以脊椎動物為宿主的情況下，雄性宿主的寄生蟲感染程度會高於雌性宿主。此現象通常被歸因至雄性激素引起之免疫抑制反應，或是為了交配而採取的高風險行為。先前文獻對於哺乳動物宿主間性別差異感染的現象已有大量之探討，但鮮少有人探討兩棲類動物寄生蟲的相關現象。本研究聚焦於台灣地區太田樹蛙與恙螨的寄生關係，探討其潛在的性別差異感染現象及其背後的生理與環境因子。我們在2023年5月至2024年5月進行每月一次的調查，研究地點為台東知本溪及花蓮美崙溪。我們發現恙螨感染率與宿主體型呈正相關，GLMM也顯示宿主體型是影響恙螨感染程度的重要因子，我們因而推測恙螨可能偏好較大的宿主。恙螨感染率與宿主身體健康狀態呈負相關，但我們無法得知其因果關係。分析結果顯示微棲地類型及濕度是影響恙螨感染程度的主要環境因子，該結果可能與恙螨的生活史相關。我們原先預期公蛙會在雄性激素和繁殖季節群聚鳴叫的影響下具有較高恙螨感染程度，研究結果卻顯示知本地區全年間雌蛙的感染強度顯著高於雄蛙且盛行率在大多數月份略高於雄蛙。知本溪與美崙溪相比之下明顯具有全年較高的恙螨盛行率，該差異可能源自於其他環境因子（例如溫泉）以及恙螨與宿主族群間的交互作用。雖然太田樹蛙的雌雄二型性可能是形塑雌性偏好感染現象的原因，但我們仍需要進一步驗證雌性偏好寄生現象背後的機制假說（例如：雌性宿主體型較大，能提供恙螨豐富的食物來源；雌性生殖與免疫投資之間具有拮抗效應；宿主性別間行為具有顯著差異）以及探討恙螨感染部位分布明顯不均的原因。
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    淡水酸化對於斑馬魚胚胎感覺運動反應之傷害
    (2024) 李冠儀; Lee, Kuan-Yi
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    以果蠅模式研究皰疹病毒出核蛋白BFRF1減緩蛋白質包涵體毒性之機制
    (2024) 許鈺暄; Hsu, Yu-Hsuan
    常見多麩醯胺酸異常擴增蛋白質引起的神經退化性疾病，有脊髓小腦共濟失調症、亨丁頓舞蹈症、齒狀紅核蒼白球萎縮症和脊髓延髓性肌肉萎縮症，這些神經退化性疾病的共同病理特徵，為神經細胞中多麩醯胺酸擴增蛋白所形成包涵體的累積，不正常蛋白折疊所形成包涵體的角色，是為疾病的成因或結果尚有爭議，但許多研究發現減少錯誤折疊蛋白質的合成，促進清除蛋白質聚集體，或降低蛋白質聚集體所產生的毒性，皆可有效減緩這類神經退化性疾病。先前研究發現，人類疱疹病毒第四型的 BFRF1 蛋白可誘導的囊泡形成，選擇性地吞噬細胞核內蛋白包涵體，促進神經母細胞瘤細胞核中突變 Huntingtin (Htt)蛋白包涵體的運送和清除。為了進一步了解 BFRF1 蛋白質能否在動物體中有類似效果，本研究利用第三型脊髓小腦共濟失調果蠅模式，測試BFRF1蛋白是否可減緩多麩醯胺酸擴增包涵體的蛋白毒性。我們發現過量表現BFRF1蛋白質，本身並不影響果蠅複眼發育，而 Atxn3 蛋白質所引起的果蠅視網膜神徑細胞退化，可因BFRF1蛋白質表現而緩解，BFRF1 蛋白質也可減少果蠅中可溶性和不溶性的 Atxn3 蛋白質。儘管壽命沒改善，但 BFRF1 蛋白質可增加第三型脊髓小腦共濟失調果蠅模式的運動功能。這些結果說明 BFRF1 蛋白質能在果蠅中抑制突變 Atxn3 蛋白的毒性，其作用可能藉誘導囊泡形成，透過細胞自噬途徑，清除選吞噬蛋白質包涵體。