生命科學專業學院—生命科學系

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本系學士班之教育目標為「培育優良之生物科教師及生命科學研究人才」雙軌並行。

因應少子化的衝擊，本系調整相關員額及教學資源之分配，在課程設計及學習活動上，特別注重學生基礎學識、研究能力和研究方法的訓練，使學生可依個人志趣作學習規劃，畢業後有更寬廣的出路。

本系碩、博士班之教育目標則以「培養生命科學研究人才」為主，並兼顧師資培育，故課程設計及學習活動以培養獨立研究能力為主要目標。

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Subject: search.filters.subject.親緣關係樹

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    鬼基因滲入可能是造成斯文豪氏蛙（Odorrana swinhoana）複合群粒核不一致的潛在原因
    (2023) 沈敬家; Shen, Chin-Chia
    由於有著不同的演化特性，粒線體和核基因有時會發生不一致的演化趨勢。這種現象稱為粒核不一致(mitonuclear discordance)，並經常造成親緣關係分析過程中的矛盾。核粒不一致的現象中經常可見劇烈的粒線體基因分化(deep mtDNA divergence)，目前已有數種理論解釋這樣的演化事件，例如不完全譜系分選、性別偏差的播遷、或是鬼基因滲入(ghost introgression)。若現今的物種中含有來自已滅絕物種的基因滲入即可定義為鬼基因滲入，這是近年演化學界中備受關注的議題，也可透過演化模型和特定基因組中的訊息來進行檢定。在本研究中，我利用粒線體基因和限制酶位點標定定序(RADseq)分析斯文豪氏赤蛙複合群的粒核不一致現象；這個複合群包含了斯文豪氏赤蛙、宇都宮臭蛙以及一個位在台灣東部的斯文豪氏赤蛙族群，三者有著分化差距大的粒線體基因。RADseq的資料顯示所有的斯文豪氏赤蛙間有著相近的親緣關係，然而粒線體基因則顯示台灣東部的斯文豪氏赤蛙族群位於整個複合群的最基群，代表現今的斯文豪氏赤蛙並不是一個單系群。透過演化族群動態模型和基因組中的族群分化，我們推測台灣的東部曾經存在一個擁有特殊粒線體基因的臭蛙屬物種，但西部的斯文豪氏赤蛙在向東擴散的過程中將其取代，而在分布重疊的區域中留下該物種的粒線體和少數核基因。這是兩棲類發生鬼基因滲入的第一篇研究，也顯示鬼基因滲入在自然界中的存在可能被低估。如果光靠粒線體基因進行物種界定或是親緣關係重建，可能會得到偏頗的結果，需加入一定數量的核基因才能更全面地描繪物種的演化進程。
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    麗紋石龍子（Plestiodon elegans）在臺灣的族群遺傳分化與隱蔽種
    (2022) 林雨昕; Lin, Yu-Hsin
    廣泛分布的物種在現今空間上的遺傳結構分布，往往是由過去的地質事件或氣候事件所造成。受惠於分子技術的進步，某些在遺傳上有分化，但在形態上卻非常相似的隱藏譜系得以被發現，顯示兩棲爬行動物在台灣的物種多樣性是被低估的。隱蔽種的發現對於演化理論 、生物地理和保育政策的制定有著深遠 的影響，也能進而探究其種化機制或是種化歷史。麗紋石龍子（ Plestiodon elegans）廣泛分布於中國大陸 、 釣魚台列嶼 、 澎湖以及台灣本島， 是台灣唯一分布海拔跨越 0到 3000公尺左右的蜥蜴，然而對此物種的族群遺傳結構研究甚少。為了 瞭解麗紋石龍子在台灣的遺傳分化，我們在全島 包含 1700公尺以上高海拔地區 、 澎湖和龜山島，以及代表中國族群的馬祖進行採集， 利用定序取得遺傳資料，包括粒線體的cytochrome b和 ND1以及核基因的 RAG-1和 PRLR片段，重建親緣關係，比較各地族群的遺傳差異和分化時間，並進行形態分析。分子遺傳結果顯示在粒線體片段中，台灣東西部的麗紋石龍子並不呈現單系群。台東附近由低到高海拔的族群為一獨立的單系群，且與台灣其餘族群的遺傳距離高於其他在琉球群島的幾個近緣種。而核基因由於序列相對保守，較無可供辨識的序列特徵 。形態分析結果顯示，台東族群的頭部鱗片 包括眶前鱗、眶後鱗、上睫鱗、下唇鱗、頸鱗）、前肢第二指指墊數和後肢第二、第四趾趾墊數 (RFII、RTII、 RTIV)、吻肛長（ SVL）以及 頭深 （HD）皆顯著不同於台灣其餘族群。綜合以上，麗紋石龍子在台東的族群應為一獨立的新種，其分類地位必須進行重新的描述。