學位論文
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Item 台灣產山椒魚的分類與阿里山山椒魚族群生態與族群遺傳研究(2008) 賴俊祥; June-Shiang Lai台灣的山椒魚屬於保育類野生動物，近年來全球兩生類下降及氣候的變遷，有關其分類及生態研究是必需進行的。在本博士論文的研究中，嚐試於探討(1)台灣現有山椒魚屬(Hynobius)的種類分類歸屬；(2)以阿里山山椒魚為生態研究對象，討論其微棲息地的需求與偏好；(3)估計阿里山山椒魚於阿里山地區的族群量，並估算其存活率，並以模型預測其族群變動；(4)阿里山山椒魚的族群遺傳結構。 我以形態及分子的資料來分析山椒魚的分類問題。我的結果顯示出在遺傳上有五個明顯的分群，而這五群在形態上亦是有區隔。採用演化種觀點，可以將這五群視為獨立的種類。其中三群分別對應於前人的發現，即台灣山椒魚、楚南氏山椒魚和阿里山山椒魚等三個有效種，另外二種則是新種。 阿里山山椒魚的分布調查共調查了阿里山地區36個林班地中共73個山葵田，在其中9個林班發現山椒魚，而這些地點共有的特色是緩坡及穩定的溪流。山椒魚的微棲地偏好則記錄山椒魚所使用的微棲地及研究地點中適合山椒魚棲息的微棲地的特性。分析顯示阿里山山椒魚偏好使用木塊作為遮蔽物，也偏好遮蔽物上長有苔類者。在遮蔽物下的基質方面，山椒魚偏好碎石基質，但避免使用植物根系組成者。山椒魚偏好使用基質的土壤pH值為中性者、高土壤溼度及適當的土壤硬度。 族群動態的監測以阿里山姐妹潭的阿里山山椒魚族群為標的。使用Jolly-Seber法估算每月的族群量在13至305隻之間。相較於前人的估算數量，此族群在這些年間沒有很大的變化。再以Cormack-Jolly-Seber model來估算此族群的存活機率及捕獲機率，得到成體及亞成體在研究期間的存活率為恆定值，分別是0.996及0.997，皆屬於高存活率。捕獲機率則是隨季節而變，捕獲機率顯著與溫濕度呈正相關。接著再使用族群投影矩陣來分析族群動態及決定此族群的成長率，估計的族群成長率為1.130，代表此族群為穩定且緩慢增長。族群成長率的敏感度及彈性分析都顯示成體的存活率是族群穩定最重要的速率。 阿里山山椒魚遺傳結構研究方面，以AMOVA分析顯示主要遺傳變異分配在山脈之間，但山脈內族群及族群內的遺傳變異也佔相當的比例。以不相合分布(mismatch distribution)分析顯示在阿里山山脈的族群呈現族群數量增加的現象。以Nested Clade Analysis分析顯示幾乎所有的族群都是有限基因交流。再以Bayesian coalescent approach來推論每一個主要clade的分歧時間，並初步推測其親緣地理關係。Item 小族群台北赤蛙(Rana taipehehsis)的族群動態與年齡結構之探討(2005) 連志台; Lien Chih-Tai台北赤蛙（Rana taipehensis van Denburgh, 1909）是一種中小型的蛙類，在台灣的分佈地點目前僅剩下三芝、楊梅、官田及內埔，且族群量都很少。本研究於2003 ~ 2004年，針對三芝、楊梅和內埔地區的族群進行野外調查及年齡結構的分析。 由標記-再捕捉的資料得知：三芝和楊梅地區的台北赤蛙生殖族群性比都偏離1：1，且三芝族群的性比（16.13：1）約是楊梅（6.97：1）的2倍。三芝地區的族群在2003及2004年的推估數量分別為：347、203隻；楊梅地區則為：544、226隻。楊梅地區台北赤蛙在兩次調查間的存活率，依雄、雌蛙不同分別隨著時間而變動；當次調查的遭遇率則依雄、雌蛙不同分別隨著累積降雨量而變動。兩者均是雄蛙比雌蛙高。 藉由趾骨鑑齡得知：台北赤蛙不論雄雌最長壽命均是4歲，但雌蛙（2.58 ±0.09歲）顯著較雄蛙（2.30 ± 0.03歲）大。推測雄蛙在1歲時即可達性成熟並加入生殖族群，雌蛙在2歲時才達性成熟。分別建立2003、2004年的年齡結構後，可推算出跨年的存活率。三芝地區2 --> 3 歲台北赤蛙的存活率：雄蛙 — 0.33；雌蛙 — 0.22。3 -->4歲的存活率：雄蛙 — 0.02；雌蛙 — 0。楊梅地區2 --> 3歲台北赤蛙的存活率：雄蛙 — 0.23；雌蛙 — 0.68。3 --> 4歲的存活率：雄蛙 — 0.06；雌蛙 — 0.12。經Multiple Linear Regression分析的結果，台北赤蛙的吻肛長因年齡、性別、年份及地點而有顯著的不同。 利用VORTEX模擬台北赤蛙的滅絕機率：當雌蛙每年的平均子代數為34隻幼蛙時，楊梅地區的族群到未來第100年時預測的滅絕機率為0；而三芝地區的族群約在未來第26年就完全滅絕了。如將三芝地區的雌蛙數量比例提高約1倍，就可使族群在未來第100年時仍有64%的存活機率，可見適當的性比對台北赤蛙族群的存續是非常重要的。而當雌蛙每年的平均子代數大幅下降時，對族群的存續也有很大的影響。