學位論文

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    喜岩菫菜複合群之親緣關係與分類研究
    (2008) 余惠如; Hui-Ju Yu
    喜岩菫菜複合群 (Viola adenothrix complex) 包含兩個在形態上非常相似的類型，即喜岩堇菜 (Viola adenothrix var. adenothrix) 與雪山菫菜 (V. adenothrix var. tsugitakaensis )，兩者皆為台灣特有類群，前者主要分布於中海拔 (1000~2500 m)，而後者主要分布於高海拔(2500~3900 m)。本研究利用形質分析與分子標記探討此複合群的親緣關係與分類問題。 利用87個樣本進行形質分析，共測量19個形態特徵。根據變異數分析(ANOVA)結果顯示在兩類群間有6個特徵 (基瓣寬、萼片寬、花軸長、側瓣鬚毛數、葉厚、葉長/葉寬) 具顯著差異；綜合區別分析(discriminate analysis) 與歸群分析 (cluster analysis) 的結果顯示兩類群在形態上已有區分為二的趨勢，但仍存有不少中間型個體。 分子分析共使用226個樣本，合併葉綠體trnV-trnM與trnG-trnS兩片段進行分析，共獲得21個變異位點，可組成21個單套型。根據AMOVA的結果顯示在喜岩菫菜與雪山菫菜間僅有2.58%的變異(P=0.17)，且兩類群共有單套型佔全部樣本比例達73.45%，顯示兩者分化程度低。推測造成形態與分子資料呈現如此趨勢，可能是此二者為近代分化，現仍處於譜系分化不完全(incomplete lineage sorting)的階段。 Tajima’s D test與mismatch distribution的結果及基因樹呈現星狀結構，推測喜岩菫菜複合群近期經歷了族群擴張。 綜合形質與分子資料分析的結果，本研究支持台灣植物誌第二版（Wang and Huang, 1993）將雪山菫菜視為喜岩菫菜的一個變種之分類處理。
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    以形態及分子證據探討玉山蠅子草種複合群的分類問題
    (2006) 林雅芳; Ya-fang Lin
    玉山蠅子草種複合群 (Silene morrisonmontana species complex) 包含玉山蠅子草 (Silene morrisonmontana)、禿玉山蠅子草 (S. morrisonmontana var. glabella) 及蓬萊蠅子草 (S. nubigena) 等三個類群，皆為臺灣特有，分布於三千公尺左右的高山地區。本研究以形質分析及分子標記對此一種複合群進行深入研究，形質分析採用12個形態特徵及2個形態比例，對123標本進行形態量化，藉由多變量分析結果推論雪山圈谷之疑問種應歸入蓬萊蠅子草。此種複合群內以植株的被毛程度、萼筒長及雌雄蕊柄長為主要的區分特徵。而分子資料則顯示此種複合群其nrDNA的ITS序列完全一致，兩葉綠體基因片段 (psbA-trnH、rps16) 累積的變異僅10個位點，各類群間基因分化的程度遠少於形態資料所預期，此種複合群應屬形態變異較為快速的物種。因在不同的類群間發現相同的基因型，推論此種複合群應為近年才開始產生基因型分化的物種。