學位論文
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Item 台灣輪生細胞黏菌分子類緣關係研究(2005) 吳向華; Hsiang-Hua Wu摘要 將台灣各地及金門地區森林土壤中所採集分離而得的26個純培養菌株,併以日本地區4 種輪生細胞黏菌,抽取基因體DNA, 以適當引子,利用PCR反應及DNA序列得到rDNA ITS1-5.8S-ITS2 區域之分子序列。引用NCBI網站之GenBank登錄之3種輪生細胞黏菌之ITS1-5.8S-ITS2 區域之分子序列,經排序後,以Mega2,PAUP 4.0等軟體分析,建構出親緣關係樹。結果紫色輪生細胞黏菌(P. violaceum)和其他菌株之輪生細胞黏菌序列差異甚大,難以排序。引用GenBank中5種網柱細胞黏菌(Dictyostelium),以5.8S序列排序,發現Polysphondylium violaceum親緣關係較接近網柱細胞黏菌(Dictyostelium),不和其他輪生細胞黏菌形成一單系群。另以GenBank登錄之9種網柱細胞黏菌及3種輪生細胞黏菌之rDNA 部分18S序列做分析,亦得到相同結論。去除P. violaceum後之其他輪生細胞黏菌,以ITS1-5.8S-ITS2序列做分析,發現純白輪生細胞黏菌(P. candidum)和偽純白輪生細胞黏菌(P. pseudocandidum)親緣關係非常接近,可能同屬一種。而台灣各地所採得之透明輪生細胞黏菌(P. pallidum)並和其類似八個種類,經形態特徵及rDNA分子序列的比對,應為新種。