陳啟明王界明2019-09-052005-8-92019-09-052005http://etds.lib.ntnu.edu.tw/cgi-bin/gs32/gsweb.cgi?o=dstdcdr&s=id=%22G0069241023%22.&%22.id.&http://rportal.lib.ntnu.edu.tw:80/handle/20.500.12235/102395摘 要 我們建立了一個簡要的模型並利用三維非晶格的Metropolis蒙地卡羅法來預測AQP0水通道膜蛋白質在穿膜部份的8根α-helix的自然狀態結構,並分析其相關的熱力學性質,接著以蒙地卡羅模擬所獲得之初步結果為基礎,加上膜外和膜內所有連接穿膜部份各α-helix的環狀分子鏈,並考慮每個胺基酸殘基上的所有原子,來進行分子動力學模擬,最後得到之AQP0穿膜部份8根α-helix的結構與X-ray繞射得到之結構比較的方均根差(RMSD)為4.056。水通道蛋白質蒙地卡羅模擬分子動力學模擬水通道蛋白質的結構預測與動力學模擬