Browsing by Author "Liao, Yuan-Tzu"

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    翠柏與台灣肖楠之分歧演化
    (2017) 廖苑孜; Liao, Yuan-Tzu
    肖楠屬是很典型的北美-東亞間斷分布物種，過去研究發現，肖楠 屬植物因為地理隔離，已產生四個種，其中親緣關係相近的物種，翠 柏(Calocedrus macrolepis)及台灣肖楠(C. formosana)已互為單系群。過去由於受限於分子工具，並不了解肖楠屬植物分歧後的遺傳差異，本 研究透過ddRADseq (double digest Restriction Associated DNA sequencing) 檢測台灣肖楠與翠柏族群基因組的分歧。原本使用48 株 個體進行分析，但ddRADseq 需要高品質之DNA，而肖楠屬植物次 級代謝物較多，以些個體無法只用，導致最後使用28 株肖楠屬植物， 分別有19 株台灣肖楠，來自4 個台灣的族群，以及9 株翠柏樣本， 來自大陸雲南。ddRADseq 獲得1,108 個單一核苷酸多型性位點 (single nucleotide polymorphism, SNP)。雖然使用的個體數較少，但由於利用ddRADseq的方法，我們獲得的SNPs仍比其他的分子工具多。 根據structure 及DAPC 檢測後，仍可發現發現台灣肖楠族群間有分 歧，但是相較於翠柏仍不明顯，又分歧的趨勢跟地理位置有關連性， 推測台灣肖楠可能受到地理位置因素出現分歧的趨勢。 關鍵字：台灣肖楠、ddRADseq、基因組分歧