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    台灣產山椒魚的分類與阿里山山椒魚族群生態與族群遺傳研究
    (2008) 賴俊祥; June-Shiang Lai
    台灣的山椒魚屬於保育類野生動物，近年來全球兩生類下降及氣候的變遷，有關其分類及生態研究是必需進行的。在本博士論文的研究中，嚐試於探討(1)台灣現有山椒魚屬(Hynobius)的種類分類歸屬；(2)以阿里山山椒魚為生態研究對象，討論其微棲息地的需求與偏好；(3)估計阿里山山椒魚於阿里山地區的族群量，並估算其存活率，並以模型預測其族群變動；(4)阿里山山椒魚的族群遺傳結構。 我以形態及分子的資料來分析山椒魚的分類問題。我的結果顯示出在遺傳上有五個明顯的分群，而這五群在形態上亦是有區隔。採用演化種觀點，可以將這五群視為獨立的種類。其中三群分別對應於前人的發現，即台灣山椒魚、楚南氏山椒魚和阿里山山椒魚等三個有效種，另外二種則是新種。 阿里山山椒魚的分布調查共調查了阿里山地區36個林班地中共73個山葵田，在其中9個林班發現山椒魚，而這些地點共有的特色是緩坡及穩定的溪流。山椒魚的微棲地偏好則記錄山椒魚所使用的微棲地及研究地點中適合山椒魚棲息的微棲地的特性。分析顯示阿里山山椒魚偏好使用木塊作為遮蔽物，也偏好遮蔽物上長有苔類者。在遮蔽物下的基質方面，山椒魚偏好碎石基質，但避免使用植物根系組成者。山椒魚偏好使用基質的土壤pH值為中性者、高土壤溼度及適當的土壤硬度。 族群動態的監測以阿里山姐妹潭的阿里山山椒魚族群為標的。使用Jolly-Seber法估算每月的族群量在13至305隻之間。相較於前人的估算數量，此族群在這些年間沒有很大的變化。再以Cormack-Jolly-Seber model來估算此族群的存活機率及捕獲機率，得到成體及亞成體在研究期間的存活率為恆定值，分別是0.996及0.997，皆屬於高存活率。捕獲機率則是隨季節而變，捕獲機率顯著與溫濕度呈正相關。接著再使用族群投影矩陣來分析族群動態及決定此族群的成長率，估計的族群成長率為1.130，代表此族群為穩定且緩慢增長。族群成長率的敏感度及彈性分析都顯示成體的存活率是族群穩定最重要的速率。 阿里山山椒魚遺傳結構研究方面，以AMOVA分析顯示主要遺傳變異分配在山脈之間，但山脈內族群及族群內的遺傳變異也佔相當的比例。以不相合分布(mismatch distribution)分析顯示在阿里山山脈的族群呈現族群數量增加的現象。以Nested Clade Analysis分析顯示幾乎所有的族群都是有限基因交流。再以Bayesian coalescent approach來推論每一個主要clade的分歧時間，並初步推測其親緣地理關係。