Browsing by Author "Huang, Chih-Wei"
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Item Differential genetic responses to the stress revealed the mutation-order adaptive divergence between two sympatric ginger species(2018-09-21) Huang, Bing-Hong; Lin, Yuan-Chien; Huang, Chih-Wei; Lu, Hsin-Pei; Luo, Min-Xin; Liao, Pei-ChunAbstract Background Divergent genetic responses to the same environmental pressures may lead sympatric ecological speciation possible. Such speciation process possibly explains rapid sympatric speciation of island species. Two island endemic ginger species Zingiber kawagoii and Z. shuanglongensis was suggested to be independently originated from inland ancestors, but their island endemism and similar morphologies and habitats lead another hypothesis of in situ ecological speciation. For understanding when and how these two species diverged, intraspecific variation was estimated from three chloroplast DNA fragments (cpDNA) and interspecific genome-wide SNPs and expression differences after saline treatment were examined by transcriptomic analyses. Results Extremely low intraspecific genetic variation was estimated by cpDNA sequences in both species: nucleotide diversity π = 0.00002 in Z. kawagoii and no nucleotide substitution but only indels found in Z. shuanglongensis. Nonsignificant inter-population genetic differentiation suggests homogenized genetic variation within species. Based on 53,683 SNPs from 13,842 polymorphic transcripts, in which 10,693 SNPs are fixed between species, Z. kawagoii and Z. shuanglongensis were estimated to be diverged since 218~ 238 thousand generations ago (complete divergence since 41.5~ 43.5 thousand generations ago). This time is more recent than the time of Taiwan Island formation. In addition, high proportion of differential expression genes (DEGs) is non-polymorphic or non-positively selected, suggesting key roles of plastic genetic divergence in broaden the selectability in incipient speciation. While some positive selected DEGs were mainly the biotic and abiotic stress-resistance genes, emphasizing the importance of adaptive divergence of stress-related genes in sympatric ecological speciation. Furthermore, the higher proportional expression of functional classes in Z. kawagoii than in Z. shuanglongensis explains the more widespread distribution of Z. kawagoii in Taiwan. Conclusions Our results contradict the previous hypothesis of independent origination of these two island endemic ginger species from SE China and SW China. Adaptive divergent responses to the stress explain how these gingers maintain genetic differentiation in sympatry. However, the recent speciation and rapid expansion make extremely low intraspecific genetic variation in these two species. This study arise a more probable speciation hypothesis of sympatric speciation within an island via the mutation-order mechanism underlying the same environmental pressure.Item 以二次模糊分段迴歸模型預測二手車價(2022) 黃至偉; Huang, Chih-Wei預測二手車的價格一直是消費者和汽車經銷商非常感興趣的話題。然而，由於預測二手車價需具備專業知識，且交易價格非常混亂，資訊也不透明，準確預測，並不容易。近年來，由於主要經濟體與開發中國家對汽車的需求暢旺，此外，由於中美貿易戰、新冠肺炎大流行、汽車晶片短缺、通貨膨脹等因素影響，新車供貨不足，導致二手車的需求量顯著提昇。價格為影響交易量的重要因素，能夠準確預測二手車價，對交易雙方極為重要。唯二手車價受製造年份、里程數、引擎排氣量、車型等諸多因素影響，準確預測車價格，並不容易，且少有研究機構或學者提出有效的解決方案。為解決此問題，本研究以基於優勢之約略集合法 (Dominance Based Rough Set Approach，DRSA) 推衍影響二手車價之核心屬性，作為預測二手車價的自變數，並以二次模糊分段迴歸模型，預測二手車價。為驗證分析架構之可行性，本研究自知名汽車拍賣網站8891.com.tw下載過去20年Toyota Altis、Honda CRV等六款車型之銷售紀錄3689筆，並以基於優勢之約略集合法擷取車齡、生產區域、品牌等七屬性為核心屬性，其後，以Toyota Altis 之銷售紀錄，預測車價。本究以20年資料中，前15年的資料訓練模型，並以後5年的資料實證模型之準確性。依據實證研究之結果，本研究所提出之模型，可準確預測二手車價。Item 多智能體強化學習中的適當橢圓影響範圍分析(2022) 陳冠綸; Chen, Kuan-Lun近幾年在機器學習領域中，強化學習的應用越來越廣泛，希望智能體在某些規範下與環境互動後，學習到好的策略與行為模式，更能夠有效地達成目標，或是讓用戶有更好的體驗。但畢竟單獨的智能體與整個環境互動是有限的，所以往往需要與其他智能體合作，得知彼此的資訊，才能更了解所處環境，以便選擇更有效的策略達成目標。不過若要讓單一智能體了解整個環境，或是與整個環境下的智能體交換資訊，不僅耗費許多時間及資源，且不切實際。因此是否可以建立通訊功能，使智能體之間可以互相通訊，找到一個合適拓展的範圍，且智能體在通訊範圍內可以彼此交換訊息，也可以有效地達成目標?在本篇論文中，利用指數衰減的特性，表現出兩智能體在相同策略下，對於彼此的影響會隨著距離的增加呈現指數衰減；並使用置信橢圓代表每一時間的隊伍，藉由置信橢圓的長短軸與隊友間距離得出合適的通訊距離模型。環境架構在星際爭霸多智能體挑戰賽（SMAC）下，訓練的好壞由勝率判斷。因此加入合適的通訊範圍訓練模型，相對於不能通訊或沒有合適通訊距離的模型，表現出勝率有更快的提升。Item 應用於多車種網路之角色導向強化學習(2022) 鄭宇恒; Zheng, Yu-Heng多車種的車聯網環境相較於單車種的環境更為現實和複雜，不同的車種對於通訊的策略會有所不同。考慮緊急情況下，救護車會更需要傳輸資料給附近的其他車輛，而不是基礎設施或衛星。為了這個目的，我們可以利用先備知識定義每個車種的行為，但在這樣的架構下將會失去對於環境的適應性和彈性。因此我們利用角色導向的 actor-critic 演算法使得相同車種的車輛會有相同的策略，並且學習選擇使用何種傳輸模式、能量以及子頻道去最大化系統效益。根據角色導向的性質，所有車輛可以依照環境和自身的車種做出更好的決定。Item 臺灣大臍蝸牛與其近緣種的種化歷史(2015) 黃致維; Huang, Chih-Wei物種是演化生物學探討的基本單位，種化研究應基於正確的物種界定。整合多種獨立證據有助於系統分類學和種化過程的推論。琉球群島位於東亞的亞洲大陸邊緣，此區的親緣關係或親緣地理研究，大多侷限於擴散能力相對高的脊椎動物和節肢動物，而侷限於陸地且擴散能力低的生物的種化歷史尚未被研究。本論文針對分別分布於臺灣東、西部、石垣島和宮古島的四種特有大臍蝸牛，探討其種化歷史。根據分子與形態證據，分布於臺灣東部的臺灣大臍蝸牛族群為隱蔽種，描述命名新種為彩虹大臍蝸牛（第二章）。由於軟體動物可用的核基因標誌有限，因此以同屬物種的轉錄體開發新的核基因標誌（第三章）。為獲得合理可用於大臍蝸牛的分子時鐘，新定序臺灣盾蝸牛、彩虹大臍蝸牛和臺灣長蝸牛的粒線體序列，建構粒線體親緣關係樹推算柄眼目和大臍蝸牛的分化時間（第四章）。根據以上結果，進一步推測物種演化樹、族群波動歷史和歷史遺傳交流（第五章）。根據兩個粒線體基因和十個核基因重建的物種樹顯示，臺灣大臍蝸牛分化於2.05百萬年前，分布於石垣島的大臍蝸牛分化自1.55百萬年前，彩虹大臍蝸牛和分布於宮古島的大臍蝸牛則種化於1.40百萬年前。彩虹大臍蝸牛和宮古島大臍蝸牛，是由地理割裂造成的種化事件並伴隨單向遺傳交流。以統計法檢測高變異分子標誌，未顯示有族群擴張的現象，而extended Bayesian skyline plot成功重建族群波動歷史。Item 隱藏種或多形性？細帶環蛺蝶（Neptis nata）幼蟲多形性初探(2017) 黃智偉; Huang, Chih-Wei細帶環蛺蝶（Neptis nata）在臺灣的族群被視為特有亞種ssp. Lutatia Fruhstorfer, 1913，一年多代，廣泛分布於全島低中海拔的地區，為廣食性物種，目前已知可利用的寄主植物包括了大麻科的朴樹（Celtis sinensis）、石朴（C. formosana）、山黃麻（Trema orientalis），榆科櫸木（Zelkova serrata），豆科水黃皮（Pongamia pinnata）、老荊藤（Millatia reticulata）、葛藤（Pueraria lobata），大戟科刺杜密（Bredelia insulana）等，由野外觀察及室內飼養之記錄顯示，細帶環蛺蝶在利用不同寄主植物的時候，其幼蟲會有不一樣的形態表現，像是利用豆科水黃皮的幼蟲體色偏褐色、利用大麻科的幼蟲體色雖然偏綠，而利用榆科櫸木的幼蟲則表現出紅色的體色。為了瞭解造成細帶環蛺蝶產生此多形性的原因以及釐清細帶環蛺蝶的分類地位，本研究經由計算利用不同寄主的幼蟲的體色表現、雌蝶野外產卵時的微棲地選擇偏好及生物條碼（DNA Barcode）分析來檢測細帶環蛺蝶在利用不同寄主植物時的幼蟲多形性確切原因為何，最後由研究結果顯示細帶環蛺蝶幼蟲多形性並非內含隱藏種或是寄主轉移，而是因利用不同寄主而造成的體色改變。 關鍵字：細帶環蛺蝶、隱藏種、多形性、寄主植物