Browsing by Author "Hsieh, Yi-Ting"

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以平行反應監測質譜法定量分析肝癌之醣蛋白生物標記
(2019) 謝宜庭; Hsieh, Yi-Ting
肝癌在癌症中致死率為第三名。然而，目前診斷肝癌的工具的靈敏度及專一性有限。甲型胎兒蛋白是目前臨床上常使用的生物標記蛋白，然後在40%的肝癌病患濃度卻是比較低的 (2 ng to 20 ng/mL )，造成誤判此需要一個好的血清標記作為肝癌的診斷，特別是針對肝癌初期的病患，因為在早期癌症是沒有症狀的。蛋白質的醣基化修飾的疾病生物標的已廣受積極探討，因為醣基化的表現量與其結構異質性之變異已與包含癌症等幾種疾病有關。此研究中，我們嘗試針對肝癌（HCC）的生物標的蛋白紅血球結合蛋白 (Haptoglobin，Hp）中的位點特異性糖基化進行量化。我們的團隊於先前已經利用非靶向質譜方法（untargeted-MS）和生物資訊分析找出可能在肝癌患者中具有表現上升的 19 個Hp 特殊醣型。為了驗證這些可能的醣胜肽，在此論文第一部份，我們開發了一種奈米探針結合質譜的技術，平行反應監測（PRM-MS），以應用於這19 個醣胜肽依據不同的醣胜肽修飾 (價數，氧化，鈉的加合物) 衍生出49個衍生物醣胜肽的定量。利用以血紅蛋白修飾的磁性奈米探針（MNP@Hb）從血清中純化出 Hp，經由酵素水解消化後，再進行親水性作用層析法 (Hydrophilic interaction chromatography，HILIC) 將醣胜肽做進一步分離與濃縮。在質譜技術方面，為了減少干擾物的干擾，每條醣胜肽都有最佳的分離窗口，有干擾勿干擾的醣胜肽前驅物就會選擇狹小的分離窗口 0.7 Da 到 1.2 Da；沒有干擾勿干擾的前驅物就會選擇1.4 Da 的分離窗口。在此論文的第二部分，將此方法應用於 51個肝炎，54個肝硬化、34個低濃度甲型胎兒蛋白 (20 ng/mL)的肝癌和17個高濃度甲型胎兒蛋白(>20 ng/mL)。利用SDS-PAGE及銀染，來檢測血紅蛋白修飾的磁性奈米探針（MNP@Hb）對紅血球單白標準品的純化效率，其純化效率約為85% 到100%。血紅蛋白修飾的磁性奈米探針2的最大純化量是 5μg。在醣胜肽的平行反應監測質譜法定量的方面，是利用碎片離子的總和及使用內標準品 (SGP) 校正醣胜肽含量。在這些疾病群中，有條醣胜肽在位點N184上的兩個分支含有核心岩藻醣基化和雙唾液酸的醣型 (GP15, m/z: 1045.43 (4+), A4G5F1S2 醣型)，在肝癌中的含量明顯上升 (p value : 0.064)。有三條在位點N184的醣胜肽 (GP13、GP40、GP47)，在高濃度甲型胎兒蛋白是明顯上升的 (p value 分別為0.031、0.034、0.0342)。在未來我們希望這四個可能的醣胜肽可以與其他標記蛋白像是甲型胎兒蛋白，提供肝癌診斷的平台。
基於行動樣式評估視覺化系統之探索研究
(2019) 謝怡婷; Hsieh, Yi-Ting
在資訊爆炸的時代裡，各種資訊在網路裡形成人類難以直接收集、管理和處理的巨量資料，就算經過整理，也較難以直觀的方式看出資料想表達出的訊息。巨量資料不只在收集與儲存很重要，資料分析與表現也十分重要，也就是如何幫助人們理解與分析大量的資料，並及時做出決策已成為重要議題，這也是近年視覺化表達研究與相關輔助工具在各領域廣受重視的原因。本研究主要探討出視覺化工具對決策的輔助效益，研究主要以EDIFICEPVR（複雜的認知活動中人與訊息之間互動的認知與設計）架構之32 個知識行動樣式（Epistemic Action Patterns, EAPs），瞭解視覺化工具或者與知識行動樣式（EPAs）的關聯。研究採用兩個案，第一個案為工業電力視覺化系統，預計採用實驗室開發之視覺化輔助系統，其中包含數值曲線圖、符號化後曲線圖、熱圖、查詢表格與分群結果呈現，以幫助使用者對機器產生的電力資料可進行巨觀與微觀的分析與比較。第二個案為主題知識地圖，透過本實驗室開發之另一個視覺化輔助系統，其中包含主題地圖、路徑推薦、主題階層樹、搜索工具與字詞推薦，以幫助使用者在大量資訊中快速且正確地找到所需的訊息。個案一與二分別透過側錄軟體評估系統專家與新手的EPAs 與透過系統有較好與較差的任務表現學習者的EPAs，藉以分析系統操作行為的差異以了解視覺化系統對不同使用者的效益。結果顯示，專家與任務表現較佳之受試者對於新手與任務表現較差之受試者，在進行任務時所採用的EPAs 與視覺輔助工具有所異同，顯見其搜尋策略並不相同，研究將於後續整理評估結果以了解視覺化系統對領域專家與新手在進行複雜決策任務的幫助，進而改善系統使之發揮更大的效益。
通例教學方案對國中階段中度智能障礙學生職業技能學習之成效
(2012) 謝宜婷; Hsieh, Yi-Ting
透過單一受試研究法中之跨受試多試探設計，本研究旨在探討通例教學方案對國中階段中度智能障礙學生職業技能學習成效之影響。參與學生為三名持有中度智能障礙的國中學生，自變項為通例教學方案，依變項為職業技能學習成效。本研究三名參與學生分別接受基線期、處理期、類化期與保留期之評量，並將蒐集之資料以視覺分析與C統計方式加以分析，以瞭解通例教學方案對三名參與學生學習職業技能之成效。並且輔以相關人員進行訪談，以瞭解本研究之社會效度。本研究結果摘要如下：一、通例教學方案對國中階段中度智能障礙學生之職業技能學習具有立即成效。二、通例教學方案對國中階段中度智能障礙學生之職業技能學習具有類化成效。三、通例教學方案對國中階段中度智能障礙學生之職業技能學習具有保留成效。訪談家長、教師與早餐店老闆娘的結果分析也顯示，本研究具有良好之社會效度。